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氨基酸密码的二进制规律-补续

 

  上次到陶老师那里想问一下我关于氨基酸密码的论文的情况,他告诉我应该有一个启动密码,两个停止密码,还有一个不参与编码的。他们分别是:

启动密码:AUG

停止密码:UAA,UGG

不用密码:UAG  

回来后我上网查找了一下,果然查出来一段资料,也提到这几个启动、停止和不用的密码,而且也从六十四卦的含义的角度进行了解释:  

南京大学  李州教授在<<易经综述>>一书是这样论述的:生死是互根的,没有死就无所谓生,没有生也不可能有死。合成细胞的能量要从老细胞的分解中获故里;只有老细胞的死亡,才有新细胞的产生。分解和复制是同一个过程;坤卦和乾卦只是生和死的关节点罢了,它们是连续的既封闭又开放的过程。从体现事物对待关系的六十四卦静态方图中,从64个生命密码子的对应关系与合成生命过程的卦义及密码子的功能的对应关系中,我们不难看出mrna(核糖核酸)的密码子u、c、a、g(尿嘧啶、胞嘧啶、腺嘌呤、鸟嘌呤)和太阴、少阴、少阳、太阳的对应关系。把克里克原模式的第二和第三碱基序列调一调,就正和原方图的对待关系一一对应。更可贵的是,作为起始密码的aug,正是风巽雷震动的益卦;作为停止密码(ugg)的,正是隐没无踪的天山遁。另一个停止密码uaa对应于蹇卦,山上的大水冲下来,路上行走困难。uag没有对应的氨基酸,也不翻译蛋白质,它的对应卦是渐卦。我认为它是一种调节基因,属于开关调控系统的基因。以四象为碱基进行组合,成六十四卦。每个卦对应于一个密码子,每个密码子都有反应的密码子。tr-na带有相应的氨基酸,在核糖体上rrna的帮助下连结成氨基酸链,进一步组成蛋白质。由此可知,构成生命体的细胞分解与组合过程与<<易经>>八卦是一致的。  

开始,我对于也有人从这个相同的角度思考问题感到高兴,也对作者的解释很佩服。后来仔细对照着研究了上面这段话,我发现他的思路与我的思路有一个假设前提是不同的,我和他的假设之间刚好是 A G 对调,而且从他上面这段话中可以同时推断出克里克的假设,如下图:

 

        

 

  我的假设           他的假设           克里克的假设

 

我开始想,是否需要修改自己的假设前提?

我在论文中原来假设的顺序和对应的二进制数字如下:

A = 1 = 00, G = 2 = 01, C = 3 = 10, U = 4 = 11,  

我想是否应该修改为?

G = 1 = 00, A = 2 = 01, C = 3 = 10, U = 4 = 11,  

但是后来仔细思考一下,无论是从西方科学的角度还是中国哲学的角度,他们的两种架设都是不对的,我的假设是正确的。

从中心法则的角度来说, 配对,C 与 G 配对。从上面的图中可以看出:我的图中 A 与 U,C 与 G 刚好是处在对角的位置,而他们都是处在以竖轴为对称的两侧。

从自然界的规律来说,一般是性质相反而数量相同的两个来配对。很显然,坐标中处于对角位置是以原点为对称点的中心对称,而中心对称的两个数对的正负性质才是刚好相反的。所以不需要修改我的假设顺序。

从中国阴阳哲学思想的角度来说,我的图中是太阴与太阳配对,少阴与少阳配对,这也是太极阴阳八卦的哲理的。这反过来也可以证明:中国古人的哲学思想是符合自然规律和真理的。

在六十四卦的对应上,他所对应的是以下的四个卦:

启动密码:AUG 对应“风雷-益”卦。

停止密码:UAA 对应“天山-遁”卦,UGG 对应“水山-蹇”卦。

不用密码:UAG 对应“风山-渐”卦。  

我所对应的是下面四个卦:

启动密码:AUG 对应“水泽-节”卦。

停止密码:UAA 对应“天山-遁”卦,UGG 对应“水山-蹇”卦。

不用密码:UAG 对应“泽山-咸”卦。  

那么,停止的两个卦因为只是 A 与 G 对调一下,所以是一样的。至于起始和不用的两个卦到底是他的对应有道理还是我的对应有道理,这就很难说了。

他说起始卦是“风雷-益”卦,这也有点道理。因为对照生命的起源理论,生命最早来源于有机物,而最早的有机分子是甲烷,而甲烷最早是在大雷闪电的作用下,空气中的气体相互合成的。打雷正好是“风雷-益”卦,大概这个时候生命就开始编码了。

我的起始卦是“水泽-节”卦,这个卦的位置刚好在两仪图中阳鱼鱼腰往上一点。这个位置是很特殊微妙的位置,我在《太极宇宙论》中关于化学元素周期律的研究中,发现所有的过渡元素全部集中在这一个区域,在关于天体形成特别是太阳系中天体形成的研究中,发现它们也都形成于这个阶段。那么生命诞生于这个区域并且从这里开始编码,也是很好理解的事情。

另外一点比较有趣的是,两个停止和一个不用的密码,都处在太阴之内,也就是两仪图中过了阴鱼鱼腰往下一点。

根据我对中国太极阴阳这种哲学思想的理解,对照现代西方科学,我认为中国古典哲学特别是中医理论中所提到的一个玄妙的很难理解的概念“气”,它其实就是“生命信息”,而这个“生命信息”也就是排列在氨基酸密码中的“碱基顺序”。同样,中医认为的“形”就是具体的物质,相当于已经组合好的蛋白质。中医说“阳化气,阴成形”,正是包含在 DNA 碱基序列中的“阳气(生命信息)”控制蛋白质的合成,也就是“成形的阴(物质)”。正因为如此,作为起始编码的“水泽-节”卦,处于两仪图阳鱼的鱼腰上面一点,对照我的化学元素周期理论和天体生成论,这个位置其中了所有的过渡元素,地球这样的第五六级天体开始形成,原始生命(有机分子)也开始出现,因而编码开始。而作为停止的两个编码,UAA “天山-遁”卦,UGG“水山-蹇”卦,则处于两仪图阴鱼的鱼腰下面一点。这时候成形的阴性物质已经够多,足以组成一个完整的生命体,因而编码停止。

不用的这个编码 UAG 对应的“泽山-咸”卦,我不太清楚“咸”卦的含义,按照古文的意思,“咸”是全部的意思。全部内容都包含在它的里面,它当然不用参与编码了。这用中国古典哲学思想来解释,叫做“无形而有用”,“无形者为尊”。那么这个编码反而是一个中心编码,它起着参照物的作用,相当于坐标的原点。